关于林权证与土地证冲突纠纷解决办法是：1、林地、土地在我国存在两种所有权性质，一种是国有，一种是集体所有，也就是说林地的所有权应当属于村委会或者村民小组2、一社种树，并办理了林权证，如果一社对其中的林地不享有所有权，可能属于林地使用权的流转，一般有30年，最长可达70年，享有林地使用权，并对林木享有所有权3、农户可能有对林木的看护费等收益，但还要看合同或者协议4、针对林地权属争议的，可向法院起诉解决。法律依据：《中华人民共和国森林法》第六条国家以培育稳定、健康、优质、高效的森林生态系统为目标，对公益林和商品林实行分类经营管理，突出主导功能，发挥多种功能，实现森林资源永续利用。第七条国家建立森林生态效益补偿制度，加大公益林保护支持力度，完善重点生态功能区转移支付政策，指导受益地区和森林生态保护地区人民政府通过协商等方式进行生态效益补偿。第八条国务院和省、自治区、直辖市人民政府可以依照国家对民族自治地方自治权的规定，对民族自治地方的森林保护和林业发展实行更加优惠的政策。
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申请林业部门确权
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应当由国土管理部门或者相关政府裁决